Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRKD1Q15139 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRKD1Q15139 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PRKD1Q15139 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRKD1Q15139 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKD1Q15139 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
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