Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBA3CQ13748 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBA3CQ13748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TUBA3CQ13748 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TUBA3CQ13748 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms