Protein–RNA interactions for Protein: Q12340

YRM1, Zinc finger transcription factor YRM1, yeastyeast

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRM1Q12340 TIP1YBR067C 633 nt7.84□□□□□ -1.15
YRM1Q12340 GGC1YDL198C 903 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 AIM1YAL046C 357 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.83□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 TVP23YDR084C 600 nt7.82□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 SWM1YDR260C 513 nt7.82□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 YHR219WYHR219W 1875 nt7.82□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 CRN1YLR429W 1956 nt7.82□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 SAC7YDR389W 1965 nt7.81□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 ENT4YLL038C 744 nt7.8□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 HEL1YKR017C 1656 nt7.79□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 LSM5YER146W 282 nt7.79□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 BAP3YDR046C 1815 nt7.79□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 ERG13YML126C 1476 nt7.79□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 YCP4YCR004C 744 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 OPI3YJR073C 621 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 PMA2YPL036W 2844 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 THP3YPR045C 1413 nt7.78□□□□□ -1.16
YRM1Q12340 YLR046CYLR046C 813 nt7.77□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 RIB1YBL033C 1038 nt7.77□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 HBS1YKR084C 1836 nt7.77□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 LAS17YOR181W 1902 nt7.76□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 IPL1YPL209C 1104 nt7.76□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 DLD3YEL071W 1491 nt7.75□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 YIA6YIL006W 1122 nt7.75□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 ADE8YDR408C 645 nt7.74□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 ABZ2YMR289W 1125 nt7.74□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 FSH2YMR222C 672 nt7.73□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 PHB2YGR231C 933 nt7.72□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 ERG6YML008C 1152 nt7.72□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 DAL7YIR031C 1665 nt7.72□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 YCR061WYCR061W 1896 nt7.72□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 RPD3YNL330C 1302 nt7.72□□□□□ -1.17
YRM1Q12340 FLX1YIL134W 936 nt7.71□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 ITR2YOL103W 1830 nt7.71□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 FET5YFL041W 1869 nt7.7□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 ECM27YJR106W 2178 nt7.7□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 ADH6YMR318C 1083 nt7.7□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 DUS3YLR401C 2007 nt7.69□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 SAM50YNL026W 1455 nt7.69□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 AFG2YLR397C 2343 nt7.68□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 INH1YDL181W 258 nt7.67□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 BIM1YER016W 1035 nt7.67□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 MSB3YNL293W 1902 nt7.67□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 YIL108WYIL108W 2091 nt7.67□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 LYS20YDL182W 1287 nt7.66□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.66□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 ADH3YMR083W 1128 nt7.66□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 KRE1YNL322C 942 nt7.66□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 POP2YNR052C 1302 nt7.66□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 VMA11YPL234C 495 nt7.65□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 RIM2YBR192W 1134 nt7.65□□□□□ -1.18
YRM1Q12340 SOD2YHR008C 702 nt7.64□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 YNL040WYNL040W 1371 nt7.63□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 YCR025CYCR025C 411 nt7.63□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 SWT21YNL187W 1074 nt7.63□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 ORT1YOR130C 879 nt7.63□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 HXT13YEL069C 1695 nt7.63□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 AMF1YOR378W 1548 nt7.62□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 RPC31YNL151C 756 nt7.62□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 YNR064CYNR064C 873 nt7.62□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 snR4snR4 186 nt7.61□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 SER2YGR208W 930 nt7.6□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 SNX3YOR357C 489 nt7.6□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 ADE16YLR028C 1776 nt7.6□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 LEU4YNL104C 1860 nt7.6□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 SUV3YPL029W 2214 nt7.59□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 PRP2YNR011C 2631 nt7.59□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 KRR1YCL059C 951 nt7.59□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 CIR2YOR356W 1896 nt7.59□□□□□ -1.19
YRM1Q12340 DPL1YDR294C 1770 nt7.59□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms