Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 FRE6YLL051C 2139 nt8.58□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 ERO1YML130C 1692 nt8.57□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 HTS1YPR033C 1641 nt8.57□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.56□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 YGR210CYGR210C 1236 nt8.56□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 SNX3YOR357C 489 nt8.56□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 snR31snR31 225 nt8.56□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 YMR007WYMR007W 381 nt8.55□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 ZAP1YJL056C 2643 nt8.54□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 KGD2YDR148C 1392 nt8.54□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 RIM2YBR192W 1134 nt8.54□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 POP2YNR052C 1302 nt8.54□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 SFP1YLR403W 2052 nt8.53□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 SAN1YDR143C 1833 nt8.53□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 RPN14YGL004C 1254 nt8.53□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 RPD3YNL330C 1302 nt8.53□□□□□ -1.04
LCB4Q12246 SRP102YKL154W 735 nt8.52□□□□□ -1.05
LCB4Q12246 HIS2YFR025C 1008 nt8.51□□□□□ -1.05
LCB4Q12246 RCR1YBR005W 642 nt8.48□□□□□ -1.05
LCB4Q12246 BUD20YLR074C 501 nt8.46□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 PTC6YCR079W 1329 nt8.46□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 YFR020WYFR020W 699 nt8.45□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 YPL108WYPL108W 507 nt8.45□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 GAS1YMR307W 1680 nt8.43□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 SSL2YIL143C 2532 nt8.43□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 EMC3YKL207W 762 nt8.42□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 YPT11YNL304W 1254 nt8.42□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 HMG2YLR450W 3138 nt8.42□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 SBP1YHL034C 885 nt8.41□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 YJL160CYJL160C 864 nt8.41□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 LSP1YPL004C 1026 nt8.41□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 ODC1YPL134C 933 nt8.41□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 TPO4YOR273C 1980 nt8.41□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 RPC31YNL151C 756 nt8.4□□□□□ -1.06
LCB4Q12246 YHL008CYHL008C 1884 nt8.39□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 PET18YCR020C 648 nt8.39□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 PSD1YNL169C 1503 nt8.39□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 YMR210WYMR210W 1350 nt8.38□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 GRH1YDR517W 1119 nt8.38□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 DPL1YDR294C 1770 nt8.38□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 RSM7YJR113C 744 nt8.37□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 PAU21YOR394W 495 nt8.37□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 PAU22YPL282C 495 nt8.37□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 UTR5YEL035C 501 nt8.34□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 CWP2YKL096W-A 279 nt8.34□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 YMR166CYMR166C 1107 nt8.34□□□□□ -1.07
LCB4Q12246 DMA2YNL116W 1569 nt8.33□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 THI3YDL080C 1830 nt8.33□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 YOR343CYOR343C 327 nt8.32□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 CYT1YOR065W 930 nt8.31□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 NPP1YCR026C 2229 nt8.3□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 CAK1YFL029C 1107 nt8.3□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 HRA1HRA1 564 nt8.29□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 YJR149WYJR149W 1215 nt8.29□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 GGA2YHR108W 1758 nt8.29□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 LEU4YNL104C 1860 nt8.29□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 YDR467CYDR467C 327 nt8.28□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 GPM1YKL152C 744 nt8.28□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.28□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 YHR218WYHR218W 1812 nt8.28□□□□□ -1.08
LCB4Q12246 YLR460CYLR460C 1131 nt8.27□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 MET22YOL064C 1074 nt8.27□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 KRR1YCL059C 951 nt8.26□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 YGR139WYGR139W 339 nt8.26□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 MDM35YKL053C-A 261 nt8.26□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 MET8YBR213W 825 nt8.26□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 OCH1YGL038C 1443 nt8.26□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.25□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 KAE1YKR038C 1161 nt8.25□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 RPS6AYPL090C 711 nt8.24□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 RPS6BYBR181C 711 nt8.24□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 RRT14YIL127C 621 nt8.23□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 ADA2YDR448W 1305 nt8.23□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 BSP1YPR171W 1731 nt8.23□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 MRP1YDR347W 966 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 CHS7YHR142W 951 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 MFT1YML062C 1179 nt8.22□□□□□ -1.09
LCB4Q12246 RNA170RNA170 169 nt8.21□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 BXI1YNL305C 894 nt8.21□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 HXK1YFR053C 1458 nt8.2□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 RPL12BYDR418W 498 nt8.2□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 OLA1YBR025C 1185 nt8.2□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 GDH1YOR375C 1365 nt8.2□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 PDC6YGR087C 1692 nt8.18□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 YMC2YBR104W 990 nt8.18□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 ELP4YPL101W 1371 nt8.18□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 HXT10YFL011W 1641 nt8.18□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.17□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.17□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 YER156CYER156C 1017 nt8.17□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 ALD5YER073W 1563 nt8.17□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 URA8YJR103W 1737 nt8.17□□□□□ -1.1
LCB4Q12246 YBL095WYBL095W 813 nt8.16□□□□□ -1.1
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