Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 TMA23YMR269W 636 nt8.23□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 RIB7YBR153W 735 nt8.22□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 SAC7YDR389W 1965 nt8.22□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 YRF1-2YER190W 5046 nt8.21□□□□□ -1.09
NFI1Q12216 TIM44YIL022W 1296 nt8.21□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 BAP3YDR046C 1815 nt8.2□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 YPI1YFR003C 468 nt8.2□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 RBG2YGR173W 1107 nt8.2□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 TIP1YBR067C 633 nt8.19□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 SLM3YDL033C 1254 nt8.18□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 YMR253CYMR253C 1245 nt8.18□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 VMA11YPL234C 495 nt8.18□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 IMO32YGR031W 1029 nt8.17□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 ERG6YML008C 1152 nt8.17□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 RRT8YOL048C 1029 nt8.16□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 YCR061WYCR061W 1896 nt8.15□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 YNR029CYNR029C 1290 nt8.15□□□□□ -1.1
NFI1Q12216 ERR3YMR323W 1314 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 CMK2YOL016C 1344 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 ERR1YOR393W 1314 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 ERR2YPL281C 1314 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 SPE4YLR146C 903 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YMR262WYMR262W 942 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 SNX3YOR357C 489 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.14□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 ELO1YJL196C 933 nt8.13□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 ADH6YMR318C 1083 nt8.13□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 MDH2YOL126C 1134 nt8.13□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YJL045WYJL045W 1905 nt8.13□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 FCP1YMR277W 2199 nt8.12□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YLR072WYLR072W 2082 nt8.12□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 ADE8YDR408C 645 nt8.12□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 RPC31YNL151C 756 nt8.11□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 HEL1YKR017C 1656 nt8.11□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 DPL1YDR294C 1770 nt8.1□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 SMC5YOL034W 3282 nt8.1□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 CKI1YLR133W 1749 nt8.1□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YNR064CYNR064C 873 nt8.1□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 ADH1YOL086C 1047 nt8.1□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YJR114WYJR114W 393 nt8.09□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 RIM2YBR192W 1134 nt8.09□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 AQR1YNL065W 1761 nt8.09□□□□□ -1.11
NFI1Q12216 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.08□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 HXT11YOL156W 1704 nt8.08□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 TRP2YER090W 1524 nt8.08□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 INH1YDL181W 258 nt8.07□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 SNZ1YMR096W 894 nt8.07□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 YMR265CYMR265C 1386 nt8.07□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 YER152CYER152C 1332 nt8.06□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 SUV3YPL029W 2214 nt8.06□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 OPI3YJR073C 621 nt8.06□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 YBL111CYBL111C 2004 nt8.05□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 FTH1YBR207W 1398 nt8.05□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 NPP2YEL016C 1482 nt8.05□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 LEU4YNL104C 1860 nt8.04□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 SRM1YGL097W 1449 nt8.04□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 KRR1YCL059C 951 nt8.04□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 HAP5YOR358W 729 nt8.04□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 KEL3YPL263C 1956 nt8.03□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 YPR126CYPR126C 309 nt8.03□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 PMT7YDR307W 1989 nt8.02□□□□□ -1.12
NFI1Q12216 SAM50YNL026W 1455 nt8.02□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 TOS2YGR221C 1869 nt8.01□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 TVP23YDR084C 600 nt8.01□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 YPL264CYPL264C 1062 nt8.01□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 DIA4YHR011W 1341 nt8.01□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 CCT5YJR064W 1689 nt8□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 RPN14YGL004C 1254 nt8□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 SPS100YHR139C 981 nt7.98□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 CRC1YOR100C 984 nt7.98□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 AAC3YBR085W 924 nt7.97□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 POB3YML069W 1659 nt7.97□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 CTI6YPL181W 1521 nt7.97□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 EDC3YEL015W 1656 nt7.96□□□□□ -1.13
NFI1Q12216 YDR467CYDR467C 327 nt7.96□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 IML3YBR107C 738 nt7.96□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 YHR131CYHR131C 2553 nt7.96□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 YJL195CYJL195C 702 nt7.95□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 SWT21YNL187W 1074 nt7.95□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 snR31snR31 225 nt7.94□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 HSM3YBR272C 1443 nt7.94□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.93□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.93□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 ACO1YLR304C 2337 nt7.93□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 CRN1YLR429W 1956 nt7.93□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 ABZ2YMR289W 1125 nt7.92□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 ECM27YJR106W 2178 nt7.92□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 CBK1YNL161W 2271 nt7.92□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 ENO2YHR174W 1314 nt7.91□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 ICL2YPR006C 1728 nt7.91□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 AMF1YOR378W 1548 nt7.9□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 KGD2YDR148C 1392 nt7.9□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 YKL053WYKL053W 375 nt7.9□□□□□ -1.14
NFI1Q12216 NDE2YDL085W 1638 nt7.89□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 HXT9YJL219W 1704 nt7.89□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 NAS6YGR232W 687 nt7.88□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 GPM1YKL152C 744 nt7.88□□□□□ -1.15
NFI1Q12216 PRP2YNR011C 2631 nt7.87□□□□□ -1.15
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