Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 CRC1YOR100C 984 nt8.57□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 SWT21YNL187W 1074 nt8.55□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 PZF1YPR186C 1290 nt8.55□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 IML3YBR107C 738 nt8.55□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 MET1YKR069W 1782 nt8.55□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 RPN14YGL004C 1254 nt8.53□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 YOR072WYOR072W 315 nt8.53□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 GNP1YDR508C 1992 nt8.53□□□□□ -1.04
TMA46Q12000 BMT5YIL096C 1011 nt8.52□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 MGM101YJR144W 810 nt8.52□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 YPL277CYPL277C 1464 nt8.51□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 MTO1YGL236C 2010 nt8.51□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 NPP2YEL016C 1482 nt8.51□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 NBA1YOL070C 1506 nt8.5□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 YRF1-2YER190W 5046 nt8.5□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 FUN14YAL008W 597 nt8.5□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 YKL053WYKL053W 375 nt8.5□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 MDL2YPL270W 2322 nt8.5□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 INH1YDL181W 258 nt8.49□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 YDR467CYDR467C 327 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 snR31snR31 225 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 UTP6YDR449C 1323 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 KGD2YDR148C 1392 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 HOS2YGL194C 1359 nt8.48□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 YEL008WYEL008W 381 nt8.47□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 AST1YBL069W 1290 nt8.47□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 MHF1YOL086W-A 273 nt8.47□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 AMF1YOR378W 1548 nt8.47□□□□□ -1.05
TMA46Q12000 MEX67YPL169C 1800 nt8.46□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 COX16YJL003W 357 nt8.46□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 ENO2YHR174W 1314 nt8.46□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 FET5YFL041W 1869 nt8.45□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 TPC1YGR096W 945 nt8.43□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 ESBP6YNL125C 2022 nt8.42□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 GPM1YKL152C 744 nt8.42□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 SCO2YBR024W 906 nt8.42□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 NPL6YMR091C 1308 nt8.42□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 THI3YDL080C 1830 nt8.42□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 SAN1YDR143C 1833 nt8.41□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 POT1YIL160C 1254 nt8.41□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 MAK32YCR019W 1092 nt8.4□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 YMR147WYMR147W 672 nt8.4□□□□□ -1.06
TMA46Q12000 ILV2YMR108W 2064 nt8.39□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 YCR049CYCR049C 447 nt8.39□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 TAF13YML098W 504 nt8.39□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 HDA1YNL021W 2121 nt8.39□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 NIF3YGL221C 867 nt8.37□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 YBL095WYBL095W 813 nt8.37□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 NAM8YHR086W 1572 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 EHD3YDR036C 1503 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 TRP2YER090W 1524 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 ARP10YDR106W 855 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 APS2YJR058C 444 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 RFC1YOR217W 2586 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 APM1YPL259C 1428 nt8.36□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 GGA2YHR108W 1758 nt8.35□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 SBP1YHL034C 885 nt8.35□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 LEU2YCL018W 1095 nt8.35□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 YKR023WYKR023W 1593 nt8.34□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 AAT1YKL106W 1356 nt8.34□□□□□ -1.07
TMA46Q12000 SRP54YPR088C 1626 nt8.33□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 STE4YOR212W 1272 nt8.33□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 THI6YPL214C 1623 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 SEM1YDR363W-A 270 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 YLR349WYLR349W 507 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 YMC2YBR104W 990 nt8.32□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 HBS1YKR084C 1836 nt8.31□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 NAS2YIL007C 663 nt8.31□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 OCA1YNL099C 717 nt8.31□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 SPE2YOL052C 1191 nt8.31□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 HXT11YOL156W 1704 nt8.31□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 TUB4YLR212C 1422 nt8.3□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 ESS1YJR017C 513 nt8.3□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 MIM1YOL026C 342 nt8.3□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 FIT1YDR534C 1587 nt8.3□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 SIR2YDL042C 1689 nt8.3□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 TOK1YJL093C 2076 nt8.3□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 YHR145CYHR145C 357 nt8.29□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 DUR3YHL016C 2208 nt8.29□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 GAL2YLR081W 1725 nt8.29□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 EMC3YKL207W 762 nt8.28□□□□□ -1.08
TMA46Q12000 REX2YLR059C 810 nt8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.9 ms