Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.44□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 GID7YCL039W 2238 nt9.43□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 HTS1YPR033C 1641 nt9.42□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 ERO1YML130C 1692 nt9.42□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 SSL2YIL143C 2532 nt9.41□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 SRP102YKL154W 735 nt9.41□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 YGR210CYGR210C 1236 nt9.4□□□□□ -0.9
DSE3Q08729 YMR007WYMR007W 381 nt9.39□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 FCY1YPR062W 477 nt9.39□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 ODC1YPL134C 933 nt9.37□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 YFR020WYFR020W 699 nt9.36□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 CWP2YKL096W-A 279 nt9.36□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 RPC31YNL151C 756 nt9.36□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 YPT11YNL304W 1254 nt9.36□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 HSL7YBR133C 2484 nt9.35□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 PTC6YCR079W 1329 nt9.34□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 GAS1YMR307W 1680 nt9.34□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 RIM8YGL045W 1629 nt9.34□□□□□ -0.91
DSE3Q08729 SBP1YHL034C 885 nt9.33□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 RCR1YBR005W 642 nt9.33□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 BSP1YPR171W 1731 nt9.33□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 DPL1YDR294C 1770 nt9.32□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.31□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 KRR1YCL059C 951 nt9.3□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 YPL108WYPL108W 507 nt9.3□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 POP2YNR052C 1302 nt9.3□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 MET2YNL277W 1461 nt9.28□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 RSM7YJR113C 744 nt9.28□□□□□ -0.92
DSE3Q08729 YGL114WYGL114W 2178 nt9.26□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 YMR209CYMR209C 1374 nt9.25□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 MDM35YKL053C-A 261 nt9.25□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 LSP1YPL004C 1026 nt9.24□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 THI3YDL080C 1830 nt9.24□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 YJL160CYJL160C 864 nt9.23□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 GGA2YHR108W 1758 nt9.22□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 LEU4YNL104C 1860 nt9.22□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 NPP1YCR026C 2229 nt9.22□□□□□ -0.93
DSE3Q08729 EMC3YKL207W 762 nt9.21□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.21□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 GPM1YKL152C 744 nt9.2□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 BUD20YLR074C 501 nt9.2□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 YMR166CYMR166C 1107 nt9.2□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 ESBP6YNL125C 2022 nt9.19□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 SFP1YLR403W 2052 nt9.19□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 YDR467CYDR467C 327 nt9.19□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 YMR210WYMR210W 1350 nt9.19□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 HEL2YDR266C 1920 nt9.18□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 DMA2YNL116W 1569 nt9.17□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 PET18YCR020C 648 nt9.17□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 YLR460CYLR460C 1131 nt9.17□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 GRH1YDR517W 1119 nt9.15□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 CAK1YFL029C 1107 nt9.15□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 MET22YOL064C 1074 nt9.15□□□□□ -0.94
DSE3Q08729 PAU21YOR394W 495 nt9.14□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 PAU22YPL282C 495 nt9.14□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 OCH1YGL038C 1443 nt9.13□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 CHS7YHR142W 951 nt9.12□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 RRT14YIL127C 621 nt9.12□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 HXT10YFL011W 1641 nt9.12□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 UTR5YEL035C 501 nt9.1□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 RNA170RNA170 169 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 YBL095WYBL095W 813 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 OLA1YBR025C 1185 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 YOR343CYOR343C 327 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 YMC2YBR104W 990 nt9.09□□□□□ -0.95
DSE3Q08729 INH1YDL181W 258 nt9.08□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 HRA1HRA1 564 nt9.08□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 NPP2YEL016C 1482 nt9.07□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 YJR149WYJR149W 1215 nt9.06□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 AAC3YBR085W 924 nt9.06□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 PDC6YGR087C 1692 nt9.06□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 MFT1YML062C 1179 nt9.05□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 YIR035CYIR035C 765 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 MRS4YKR052C 915 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 BXI1YNL305C 894 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 RPS6AYPL090C 711 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 RPS6BYBR181C 711 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 DTR1YBR180W 1719 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 ILV2YMR108W 2064 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 PSD1YNL169C 1503 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 AGP3YFL055W 1677 nt9.04□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 MRP1YDR347W 966 nt9.03□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 YER156CYER156C 1017 nt9.03□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 TMS1YDR105C 1422 nt9.03□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 YHR218WYHR218W 1812 nt9.03□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 ADA2YDR448W 1305 nt9.03□□□□□ -0.96
DSE3Q08729 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.01□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 CYT1YOR065W 930 nt9.01□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 GDH1YOR375C 1365 nt9□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 YJL009WYJL009W 327 nt9□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 BUB2YMR055C 921 nt8.99□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 TPN1YGL186C 1740 nt8.99□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 AAT1YKL106W 1356 nt8.99□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 YPR084WYPR084W 1371 nt8.99□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 YPT31YER031C 672 nt8.98□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 RHO1YPR165W 630 nt8.98□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.97□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.97□□□□□ -0.97
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