Protein–RNA interactions for Protein: Q06190

PPP2R3A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R3AQ06190 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPP2R3AQ06190 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPP2R3AQ06190 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP2R3AQ06190 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP2R3AQ06190 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP2R3AQ06190 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP2R3AQ06190 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms