Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPN12Q05209 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPN12Q05209 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTPN12Q05209 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTPN12Q05209 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPN12Q05209 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPN12Q05209 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms