Protein–RNA interactions for Protein: Q04301

VBA1, Vacuolar basic amino acid transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA1Q04301 GGA2YHR108W 1758 nt7.41□□□□□ -1.22
VBA1Q04301 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.4□□□□□ -1.22
VBA1Q04301 DIA4YHR011W 1341 nt7.4□□□□□ -1.22
VBA1Q04301 GAL2YLR081W 1725 nt7.39□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 RIB2YOL066C 1776 nt7.38□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 TVP23YDR084C 600 nt7.38□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 PFS2YNL317W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YDR306CYDR306C 1437 nt7.36□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 MRS4YKR052C 915 nt7.36□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 LEA1YPL213W 717 nt7.36□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.35□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.35□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.35□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 RBG2YGR173W 1107 nt7.35□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 ESS1YJR017C 513 nt7.35□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YKL053WYKL053W 375 nt7.35□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 HSV2YGR223C 1347 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 snR86snR86 1004 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 SBP1YHL034C 885 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 TPN1YGL186C 1740 nt7.34□□□□□ -1.23
VBA1Q04301 MDH2YOL126C 1134 nt7.32□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 SAN1YDR143C 1833 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 ABP1YCR088W 1779 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 YNR029CYNR029C 1290 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 AAC3YBR085W 924 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 TOK1YJL093C 2076 nt7.31□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 SPS100YHR139C 981 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 SNZ1YMR096W 894 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 YPR126CYPR126C 309 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 GNP1YDR508C 1992 nt7.29□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 AMF1YOR378W 1548 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 SLM3YDL033C 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 YNL190WYNL190W 615 nt7.28□□□□□ -1.24
VBA1Q04301 MET30YIL046W 1923 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 PUS7YOR243C 2031 nt7.27□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 PMT7YDR307W 1989 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 ADH1YOL086C 1047 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 HIS3YOR202W 663 nt7.26□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 ABZ2YMR289W 1125 nt7.25□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 AIM34YMR003W 597 nt7.24□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 TMS1YDR105C 1422 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 ENO2YHR174W 1314 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 LAS17YOR181W 1902 nt7.23□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 IML3YBR107C 738 nt7.22□□□□□ -1.25
VBA1Q04301 ALR1YOL130W 2580 nt7.21□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 GAS1YMR307W 1680 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 LYS20YDL182W 1287 nt7.2□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 NDE2YDL085W 1638 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 ITR1YDR497C 1755 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 PAR32YDL173W 888 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 SRP54YPR088C 1626 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 CCT5YJR064W 1689 nt7.19□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 CTI6YPL181W 1521 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 PRC1YMR297W 1599 nt7.18□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 YJL009WYJL009W 327 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 PTC6YCR079W 1329 nt7.17□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 TPC1YGR096W 945 nt7.16□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 YBR056WYBR056W 1506 nt7.16□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 YJL195CYJL195C 702 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 Q0010Q0010 387 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 LEU2YCL018W 1095 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 TIF3YPR163C 1311 nt7.15□□□□□ -1.26
VBA1Q04301 FRA1YLL029W 2250 nt7.15□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 NAM8YHR086W 1572 nt7.14□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 MEP1YGR121C 1479 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 YNL140CYNL140C 570 nt7.13□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 BEM1YBR200W 1656 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 CHA1YCL064C 1083 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 TAF13YML098W 504 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 YPL264CYPL264C 1062 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 MET13YGL125W 1803 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 WSC4YHL028W 1818 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 MRN1YPL184C 1839 nt7.12□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 REX2YLR059C 810 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 MHF1YOL086W-A 273 nt7.11□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 TOP3YLR234W 1971 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 BUD31YCR063W 474 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 GLY1YEL046C 1164 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 SPE4YLR146C 903 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 HXT9YJL219W 1704 nt7.1□□□□□ -1.27
VBA1Q04301 INO1YJL153C 1602 nt7.09□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 LRO1YNR008W 1986 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 INM1YHR046C 888 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 YPT11YNL304W 1254 nt7.08□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 TOM71YHR117W 1920 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 YER152CYER152C 1332 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 RRT6YGL146C 936 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 POT1YIL160C 1254 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 YJR149WYJR149W 1215 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 ATP10YLR393W 840 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 BUB2YMR055C 921 nt7.07□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 SGF73YGL066W 1974 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 TGL5YOR081C 2250 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 YEL008WYEL008W 381 nt7.06□□□□□ -1.28
VBA1Q04301 YIR035CYIR035C 765 nt7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51 ms