Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 SWT21YNL187W 1074 nt9.9□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 YOR325WYOR325W 474 nt9.9□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 snR31snR31 225 nt9.9□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 MFG1YDL233W 1377 nt9.89□□□□□ -0.83
UBX2Q04228 YMR210WYMR210W 1350 nt9.88□□□□□ -0.83
UBX2Q04228 SRP54YPR088C 1626 nt9.87□□□□□ -0.83
UBX2Q04228 OPI10YOL032W 741 nt9.87□□□□□ -0.83
UBX2Q04228 YMR209CYMR209C 1374 nt9.86□□□□□ -0.83
UBX2Q04228 MET1YKR069W 1782 nt9.83□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 YPT11YNL304W 1254 nt9.83□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 EDC2YER035W 438 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 RPN14YGL004C 1254 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 YKL053WYKL053W 375 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 LSP1YPL004C 1026 nt9.82□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 KAE1YKR038C 1161 nt9.81□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 HAP5YOR358W 729 nt9.81□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 GDH1YOR375C 1365 nt9.8□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 YFR020WYFR020W 699 nt9.8□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 RSM7YJR113C 744 nt9.8□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 HOG1YLR113W 1308 nt9.8□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 SFL1YOR140W 2301 nt9.79□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 URA8YJR103W 1737 nt9.79□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 YMR166CYMR166C 1107 nt9.79□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 TOS1YBR162C 1368 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 GID7YCL039W 2238 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 MFT1YML062C 1179 nt9.78□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 ITR2YOL103W 1830 nt9.77□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 COQ8YGL119W 1506 nt9.77□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 YMR265CYMR265C 1386 nt9.77□□□□□ -0.84
UBX2Q04228 DLD3YEL071W 1491 nt9.76□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 CRC1YOR100C 984 nt9.75□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 ARO8YGL202W 1503 nt9.75□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 SUV3YPL029W 2214 nt9.75□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 YHL008CYHL008C 1884 nt9.74□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 SDH8YBR269C 417 nt9.74□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 YMR206WYMR206W 942 nt9.73□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 ADA2YDR448W 1305 nt9.73□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 PET18YCR020C 648 nt9.72□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 VMA11YPL234C 495 nt9.72□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 UGP1YKL035W 1500 nt9.72□□□□□ -0.85
UBX2Q04228 HIS2YFR025C 1008 nt9.71□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 TAD2YJL035C 753 nt9.71□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 YLR460CYLR460C 1131 nt9.71□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 PRE5YMR314W 705 nt9.7□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 SAN1YDR143C 1833 nt9.7□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 KES1YPL145C 1305 nt9.69□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 UTR5YEL035C 501 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 RRT14YIL127C 621 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 BAP3YDR046C 1815 nt9.68□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 SGA1YIL099W 1650 nt9.67□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 GAS1YMR307W 1680 nt9.67□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 YPR084WYPR084W 1371 nt9.67□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 PTC6YCR079W 1329 nt9.67□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 ELP4YPL101W 1371 nt9.66□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 CAK1YFL029C 1107 nt9.65□□□□□ -0.86
UBX2Q04228 GID8YMR135C 1368 nt9.64□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 SBP1YHL034C 885 nt9.64□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 SNX3YOR357C 489 nt9.64□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 KGD2YDR148C 1392 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 PSD1YNL169C 1503 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 CHS7YHR142W 951 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 LSR1LSR1 1175 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 ZAP1YJL056C 2643 nt9.63□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 YER156CYER156C 1017 nt9.61□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 PET494YNR045W 1470 nt9.6□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 YJR149WYJR149W 1215 nt9.6□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 OCH1YGL038C 1443 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 ADE1YAR015W 921 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 OLA1YBR025C 1185 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 YHR219WYHR219W 1875 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 HXK1YFR053C 1458 nt9.59□□□□□ -0.87
UBX2Q04228 YJL043WYJL043W 774 nt9.58□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 FUS3YBL016W 1062 nt9.58□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 RPS6AYPL090C 711 nt9.58□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 RPS6BYBR181C 711 nt9.58□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 YKL133CYKL133C 1392 nt9.58□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 RPD3YNL330C 1302 nt9.57□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 TDH1YJL052W 999 nt9.57□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 ALD5YER073W 1563 nt9.56□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 YPL247CYPL247C 1572 nt9.55□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 GTB1YDR221W 2109 nt9.53□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 YPT31YER031C 672 nt9.53□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 BXI1YNL305C 894 nt9.53□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 MET22YOL064C 1074 nt9.53□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 MRS6YOR370C 1812 nt9.53□□□□□ -0.88
UBX2Q04228 NUP53YMR153W 1428 nt9.51□□□□□ -0.89
UBX2Q04228 CYT1YOR065W 930 nt9.49□□□□□ -0.89
UBX2Q04228 KRR1YCL059C 951 nt9.47□□□□□ -0.89
UBX2Q04228 YDR476CYDR476C 675 nt9.47□□□□□ -0.89
UBX2Q04228 PDC6YGR087C 1692 nt9.46□□□□□ -0.89
UBX2Q04228 ODC1YPL134C 933 nt9.45□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 DMA2YNL116W 1569 nt9.45□□□□□ -0.9
UBX2Q04228 SSL2YIL143C 2532 nt9.43□□□□□ -0.9
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