Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E2F1Q01094 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
E2F1Q01094 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E2F1Q01094 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E2F1Q01094 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F1Q01094 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms