Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1BQ00975 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1BQ00975 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1BQ00975 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNA1BQ00975 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA1BQ00975 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA1BQ00975 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNA1BQ00975 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms