Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX6-1P78426 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX6-1P78426 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKX6-1P78426 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NKX6-1P78426 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKX6-1P78426 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms