Protein–RNA interactions for Protein: P53867

ATG4, Cysteine protease ATG4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG4P53867 DIG1YPL049C 1359 nt7.59□□□□□ -1.2
ATG4P53867 LSB6YJL100W 1824 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 TOM20YGR082W 552 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 YKR012CYKR012C 378 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 YMR007WYMR007W 381 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 LEU2YCL018W 1095 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 QDR2YIL121W 1629 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 YDR306CYDR306C 1437 nt7.58□□□□□ -1.2
ATG4P53867 YLR046CYLR046C 813 nt7.57□□□□□ -1.2
ATG4P53867 TOM71YHR117W 1920 nt7.56□□□□□ -1.2
ATG4P53867 HTS1YPR033C 1641 nt7.56□□□□□ -1.2
ATG4P53867 NAM8YHR086W 1572 nt7.55□□□□□ -1.2
ATG4P53867 YLR173WYLR173W 1827 nt7.55□□□□□ -1.2
ATG4P53867 ELO1YJL196C 933 nt7.55□□□□□ -1.2
ATG4P53867 BUD20YLR074C 501 nt7.53□□□□□ -1.2
ATG4P53867 SWT21YNL187W 1074 nt7.53□□□□□ -1.2
ATG4P53867 RCR1YBR005W 642 nt7.53□□□□□ -1.2
ATG4P53867 FTH1YBR207W 1398 nt7.53□□□□□ -1.2
ATG4P53867 SDS24YBR214W 1584 nt7.53□□□□□ -1.2
ATG4P53867 KEL3YPL263C 1956 nt7.53□□□□□ -1.2
ATG4P53867 SRP102YKL154W 735 nt7.52□□□□□ -1.21
ATG4P53867 YTH1YPR107C 627 nt7.52□□□□□ -1.21
ATG4P53867 SFL1YOR140W 2301 nt7.52□□□□□ -1.21
ATG4P53867 PUS7YOR243C 2031 nt7.52□□□□□ -1.21
ATG4P53867 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.51□□□□□ -1.21
ATG4P53867 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.51□□□□□ -1.21
ATG4P53867 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.51□□□□□ -1.21
ATG4P53867 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.51□□□□□ -1.21
ATG4P53867 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.51□□□□□ -1.21
ATG4P53867 TPN1YGL186C 1740 nt7.5□□□□□ -1.21
ATG4P53867 UGP1YKL035W 1500 nt7.5□□□□□ -1.21
ATG4P53867 ITR2YOL103W 1830 nt7.5□□□□□ -1.21
ATG4P53867 ENO1YGR254W 1314 nt7.5□□□□□ -1.21
ATG4P53867 HXK1YFR053C 1458 nt7.49□□□□□ -1.21
ATG4P53867 COQ8YGL119W 1506 nt7.49□□□□□ -1.21
ATG4P53867 ERO1YML130C 1692 nt7.49□□□□□ -1.21
ATG4P53867 REX2YLR059C 810 nt7.49□□□□□ -1.21
ATG4P53867 GNP1YDR508C 1992 nt7.49□□□□□ -1.21
ATG4P53867 DLD3YEL071W 1491 nt7.49□□□□□ -1.21
ATG4P53867 VBA3YCL069W 1377 nt7.48□□□□□ -1.21
ATG4P53867 YMR209CYMR209C 1374 nt7.48□□□□□ -1.21
ATG4P53867 YGR210CYGR210C 1236 nt7.48□□□□□ -1.21
ATG4P53867 YLR280CYLR280C 351 nt7.48□□□□□ -1.21
ATG4P53867 MET1YKR069W 1782 nt7.48□□□□□ -1.21
ATG4P53867 MTO1YGL236C 2010 nt7.47□□□□□ -1.21
ATG4P53867 SUV3YPL029W 2214 nt7.47□□□□□ -1.21
ATG4P53867 FCY1YPR062W 477 nt7.47□□□□□ -1.21
ATG4P53867 ARO8YGL202W 1503 nt7.46□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YHL008CYHL008C 1884 nt7.45□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.45□□□□□ -1.22
ATG4P53867 NAS6YGR232W 687 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YKL053WYKL053W 375 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG4P53867 HAP5YOR358W 729 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG4P53867 snR31snR31 225 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YMR265CYMR265C 1386 nt7.44□□□□□ -1.22
ATG4P53867 RTG2YGL252C 1767 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG4P53867 SRP54YPR088C 1626 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG4P53867 HIS2YFR025C 1008 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YOR343CYOR343C 327 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YRF1-2YER190W 5046 nt7.43□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YPL108WYPL108W 507 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG4P53867 GID8YMR135C 1368 nt7.42□□□□□ -1.22
ATG4P53867 CRC1YOR100C 984 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG4P53867 VMA11YPL234C 495 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG4P53867 ALD5YER073W 1563 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG4P53867 SGA1YIL099W 1650 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG4P53867 YHR219WYHR219W 1875 nt7.41□□□□□ -1.22
ATG4P53867 GRH1YDR517W 1119 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG4P53867 RPN14YGL004C 1254 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG4P53867 KES1YPL145C 1305 nt7.4□□□□□ -1.22
ATG4P53867 ZAP1YJL056C 2643 nt7.4□□□□□ -1.23
ATG4P53867 LSR1LSR1 1175 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG4P53867 ALR1YOL130W 2580 nt7.39□□□□□ -1.23
ATG4P53867 SAN1YDR143C 1833 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG4P53867 HRA1HRA1 564 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YJL160CYJL160C 864 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG4P53867 CYT1YOR065W 930 nt7.38□□□□□ -1.23
ATG4P53867 MRS6YOR370C 1812 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 RPL12BYDR418W 498 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 BUR6YER159C 429 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YFR020WYFR020W 699 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 FAF1YIL019W 1041 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 EMC3YKL207W 762 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YPT11YNL304W 1254 nt7.37□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YKL133CYKL133C 1392 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG4P53867 THI6YPL214C 1623 nt7.36□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.35□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YMR210WYMR210W 1350 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG4P53867 PSD1YNL169C 1503 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG4P53867 DUR3YHL016C 2208 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG4P53867 PUS5YLR165C 765 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG4P53867 SNX3YOR357C 489 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG4P53867 RIM2YBR192W 1134 nt7.34□□□□□ -1.23
ATG4P53867 YHM2YMR241W 945 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG4P53867 SNU66YOR308C 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG4P53867 GCD11YER025W 1584 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG4P53867 KGD2YDR148C 1392 nt7.33□□□□□ -1.24
ATG4P53867 BNS1YGR230W 414 nt7.32□□□□□ -1.24
ATG4P53867 RPD3YNL330C 1302 nt7.31□□□□□ -1.24
ATG4P53867 MRP1YDR347W 966 nt7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.5 ms