Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDE6CP51160 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE6CP51160 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE6CP51160 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE6CP51160 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE6CP51160 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE6CP51160 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms