Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
MTHFSP49914 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
MTHFSP49914 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
MTHFSP49914 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
MTHFSP49914 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.88■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
MTHFSP49914 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MTHFSP49914 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms