Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC2P49815 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC2P49815 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TSC2P49815 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TSC2P49815 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC2P49815 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC2P49815 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC2P49815 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC2P49815 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC2P49815 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TSC2P49815 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC2P49815 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC2P49815 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC2P49815 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC2P49815 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC2P49815 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TSC2P49815 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TSC2P49815 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TSC2P49815 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSC2P49815 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TSC2P49815 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSC2P49815 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSC2P49815 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TSC2P49815 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TSC2P49815 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSC2P49815 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TSC2P49815 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC2P49815 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TSC2P49815 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TSC2P49815 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TSC2P49815 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TSC2P49815 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC2P49815 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC2P49815 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC2P49815 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TSC2P49815 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSC2P49815 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TSC2P49815 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC2P49815 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TSC2P49815 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC2P49815 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TSC2P49815 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSC2P49815 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TSC2P49815 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TSC2P49815 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC2P49815 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC2P49815 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC2P49815 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC2P49815 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TSC2P49815 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC2P49815 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC2P49815 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC2P49815 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TSC2P49815 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSC2P49815 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TSC2P49815 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC2P49815 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC2P49815 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TSC2P49815 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSC2P49815 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSC2P49815 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TSC2P49815 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSC2P49815 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TSC2P49815 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSC2P49815 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TSC2P49815 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TSC2P49815 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TSC2P49815 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TSC2P49815 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TSC2P49815 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TSC2P49815 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSC2P49815 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TSC2P49815 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TSC2P49815 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TSC2P49815 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TSC2P49815 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TSC2P49815 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
TSC2P49815 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC2P49815 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC2P49815 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TSC2P49815 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSC2P49815 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TSC2P49815 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TSC2P49815 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms