Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MKI67P46013 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MKI67P46013 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKI67P46013 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MKI67P46013 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
MKI67P46013 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKI67P46013 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MKI67P46013 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKI67P46013 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MKI67P46013 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKI67P46013 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
MKI67P46013 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MKI67P46013 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MKI67P46013 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MKI67P46013 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MKI67P46013 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
MKI67P46013 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
MKI67P46013 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MKI67P46013 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKI67P46013 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKI67P46013 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKI67P46013 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKI67P46013 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKI67P46013 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MKI67P46013 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
MKI67P46013 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKI67P46013 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKI67P46013 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MKI67P46013 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MKI67P46013 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKI67P46013 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKI67P46013 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKI67P46013 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKI67P46013 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MKI67P46013 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKI67P46013 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKI67P46013 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MKI67P46013 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
MKI67P46013 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKI67P46013 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKI67P46013 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKI67P46013 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MKI67P46013 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKI67P46013 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKI67P46013 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MKI67P46013 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKI67P46013 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKI67P46013 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKI67P46013 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKI67P46013 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKI67P46013 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKI67P46013 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKI67P46013 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKI67P46013 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKI67P46013 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKI67P46013 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKI67P46013 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKI67P46013 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKI67P46013 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKI67P46013 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKI67P46013 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
MKI67P46013 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKI67P46013 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MKI67P46013 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKI67P46013 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKI67P46013 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKI67P46013 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKI67P46013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKI67P46013 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKI67P46013 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKI67P46013 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MKI67P46013 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKI67P46013 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MKI67P46013 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKI67P46013 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKI67P46013 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKI67P46013 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKI67P46013 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKI67P46013 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MKI67P46013 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKI67P46013 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MKI67P46013 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKI67P46013 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKI67P46013 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKI67P46013 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKI67P46013 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKI67P46013 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKI67P46013 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKI67P46013 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
MKI67P46013 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKI67P46013 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKI67P46013 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKI67P46013 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKI67P46013 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKI67P46013 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKI67P46013 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKI67P46013 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKI67P46013 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKI67P46013 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKI67P46013 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms