Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP8P40818 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP8P40818 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP8P40818 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP8P40818 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP8P40818 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP8P40818 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP8P40818 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP8P40818 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP8P40818 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP8P40818 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP8P40818 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP8P40818 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP8P40818 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP8P40818 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP8P40818 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP8P40818 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP8P40818 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP8P40818 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP8P40818 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP8P40818 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP8P40818 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP8P40818 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP8P40818 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP8P40818 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP8P40818 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP8P40818 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP8P40818 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP8P40818 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP8P40818 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP8P40818 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP8P40818 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP8P40818 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP8P40818 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP8P40818 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP8P40818 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP8P40818 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP8P40818 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP8P40818 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP8P40818 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP8P40818 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP8P40818 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP8P40818 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP8P40818 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP8P40818 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP8P40818 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP8P40818 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP8P40818 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP8P40818 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP8P40818 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP8P40818 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP8P40818 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP8P40818 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP8P40818 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP8P40818 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP8P40818 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP8P40818 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP8P40818 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP8P40818 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP8P40818 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
USP8P40818 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP8P40818 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP8P40818 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP8P40818 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP8P40818 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP8P40818 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP8P40818 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP8P40818 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP8P40818 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP8P40818 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP8P40818 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP8P40818 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP8P40818 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP8P40818 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP8P40818 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP8P40818 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP8P40818 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP8P40818 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP8P40818 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP8P40818 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP8P40818 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP8P40818 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP8P40818 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP8P40818 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP8P40818 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP8P40818 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP8P40818 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP8P40818 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP8P40818 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
USP8P40818 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP8P40818 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP8P40818 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP8P40818 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP8P40818 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.6 ms