Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt11.64□□□□□ -0.55
PDR11P40550 SUP51tL(UAA)J 84 nt11.64□□□□□ -0.55
PDR11P40550 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt11.64□□□□□ -0.55
PDR11P40550 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt11.64□□□□□ -0.55
PDR11P40550 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt11.64□□□□□ -0.55
PDR11P40550 SRP54YPR088C 1626 nt11.63□□□□□ -0.55
PDR11P40550 UME6YDR207C 2511 nt11.62□□□□□ -0.55
PDR11P40550 GID8YMR135C 1368 nt11.62□□□□□ -0.55
PDR11P40550 MRS6YOR370C 1812 nt11.61□□□□□ -0.55
PDR11P40550 ARO8YGL202W 1503 nt11.6□□□□□ -0.55
PDR11P40550 EDC2YER035W 438 nt11.59□□□□□ -0.55
PDR11P40550 YHR219WYHR219W 1875 nt11.58□□□□□ -0.56
PDR11P40550 YJR149WYJR149W 1215 nt11.58□□□□□ -0.56
PDR11P40550 HAP5YOR358W 729 nt11.58□□□□□ -0.56
PDR11P40550 YMR265CYMR265C 1386 nt11.57□□□□□ -0.56
PDR11P40550 SAN1YDR143C 1833 nt11.56□□□□□ -0.56
PDR11P40550 LSP1YPL004C 1026 nt11.56□□□□□ -0.56
PDR11P40550 RIM2YBR192W 1134 nt11.55□□□□□ -0.56
PDR11P40550 MUP1YGR055W 1725 nt11.53□□□□□ -0.56
PDR11P40550 KGD2YDR148C 1392 nt11.52□□□□□ -0.57
PDR11P40550 YKL133CYKL133C 1392 nt11.52□□□□□ -0.57
PDR11P40550 KES1YPL145C 1305 nt11.5□□□□□ -0.57
PDR11P40550 VMA11YPL234C 495 nt11.49□□□□□ -0.57
PDR11P40550 ADA2YDR448W 1305 nt11.49□□□□□ -0.57
PDR11P40550 ELP4YPL101W 1371 nt11.48□□□□□ -0.57
PDR11P40550 YFR020WYFR020W 699 nt11.48□□□□□ -0.57
PDR11P40550 SDH8YBR269C 417 nt11.48□□□□□ -0.57
PDR11P40550 COQ8YGL119W 1506 nt11.46□□□□□ -0.57
PDR11P40550 SPT20YOL148C 1815 nt11.46□□□□□ -0.58
PDR11P40550 MRP1YDR347W 966 nt11.45□□□□□ -0.58
PDR11P40550 YMR166CYMR166C 1107 nt11.45□□□□□ -0.58
PDR11P40550 YPL247CYPL247C 1572 nt11.45□□□□□ -0.58
PDR11P40550 PTC6YCR079W 1329 nt11.44□□□□□ -0.58
PDR11P40550 SNX3YOR357C 489 nt11.43□□□□□ -0.58
PDR11P40550 snR31snR31 225 nt11.43□□□□□ -0.58
PDR11P40550 BAP3YDR046C 1815 nt11.41□□□□□ -0.58
PDR11P40550 PRE5YMR314W 705 nt11.41□□□□□ -0.58
PDR11P40550 HOL1YNR055C 1761 nt11.4□□□□□ -0.58
PDR11P40550 RPS6AYPL090C 711 nt11.39□□□□□ -0.59
PDR11P40550 RPS6BYBR181C 711 nt11.39□□□□□ -0.59
PDR11P40550 SGA1YIL099W 1650 nt11.39□□□□□ -0.59
PDR11P40550 GAS1YMR307W 1680 nt11.37□□□□□ -0.59
PDR11P40550 GDH1YOR375C 1365 nt11.37□□□□□ -0.59
PDR11P40550 YPT11YNL304W 1254 nt11.36□□□□□ -0.59
PDR11P40550 CMP2YML057W 1815 nt11.36□□□□□ -0.59
PDR11P40550 ZAP1YJL056C 2643 nt11.35□□□□□ -0.59
PDR11P40550 CAK1YFL029C 1107 nt11.35□□□□□ -0.59
PDR11P40550 RPN14YGL004C 1254 nt11.35□□□□□ -0.59
PDR11P40550 BXI1YNL305C 894 nt11.34□□□□□ -0.59
PDR11P40550 ADE1YAR015W 921 nt11.33□□□□□ -0.6
PDR11P40550 SBP1YHL034C 885 nt11.29□□□□□ -0.6
PDR11P40550 RSM7YJR113C 744 nt11.29□□□□□ -0.6
PDR11P40550 MFT1YML062C 1179 nt11.29□□□□□ -0.6
PDR11P40550 RPD3YNL330C 1302 nt11.29□□□□□ -0.6
PDR11P40550 OCH1YGL038C 1443 nt11.28□□□□□ -0.6
PDR11P40550 YER156CYER156C 1017 nt11.27□□□□□ -0.6
PDR11P40550 TAD2YJL035C 753 nt11.27□□□□□ -0.6
PDR11P40550 UGP1YKL035W 1500 nt11.27□□□□□ -0.6
PDR11P40550 MET22YOL064C 1074 nt11.26□□□□□ -0.61
PDR11P40550 YJL043WYJL043W 774 nt11.24□□□□□ -0.61
PDR11P40550 YIL168WYIL168W 384 nt11.22□□□□□ -0.61
PDR11P40550 THI3YDL080C 1830 nt11.21□□□□□ -0.62
PDR11P40550 RRT14YIL127C 621 nt11.2□□□□□ -0.62
PDR11P40550 RNA170RNA170 169 nt11.2□□□□□ -0.62
PDR11P40550 PET494YNR045W 1470 nt11.2□□□□□ -0.62
PDR11P40550 SSL2YIL143C 2532 nt11.19□□□□□ -0.62
PDR11P40550 NCA3YJL116C 1014 nt11.18□□□□□ -0.62
PDR11P40550 RPC31YNL151C 756 nt11.18□□□□□ -0.62
PDR11P40550 SHC1YER096W 1539 nt11.17□□□□□ -0.62
PDR11P40550 TDH1YJL052W 999 nt11.17□□□□□ -0.62
PDR11P40550 FUS3YBL016W 1062 nt11.17□□□□□ -0.62
PDR11P40550 DPL1YDR294C 1770 nt11.16□□□□□ -0.62
PDR11P40550 YLR460CYLR460C 1131 nt11.14□□□□□ -0.63
PDR11P40550 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt11.14□□□□□ -0.63
PDR11P40550 ODC1YPL134C 933 nt11.13□□□□□ -0.63
PDR11P40550 NUP53YMR153W 1428 nt11.13□□□□□ -0.63
PDR11P40550 PDC6YGR087C 1692 nt11.12□□□□□ -0.63
PDR11P40550 CHS7YHR142W 951 nt11.12□□□□□ -0.63
PDR11P40550 YJL225CYJL225C 5277 nt11.12□□□□□ -0.63
PDR11P40550 YPR084WYPR084W 1371 nt11.12□□□□□ -0.63
PDR11P40550 GGA2YHR108W 1758 nt11.09□□□□□ -0.63
PDR11P40550 RRT6YGL146C 936 nt11.09□□□□□ -0.63
PDR11P40550 COS10YNR075W 1125 nt11.09□□□□□ -0.63
PDR11P40550 RHO1YPR165W 630 nt11.09□□□□□ -0.63
PDR11P40550 HAC1YFL031W 717 nt11.06□□□□□ -0.64
PDR11P40550 GPM1YKL152C 744 nt11.06□□□□□ -0.64
PDR11P40550 ATP2YJR121W 1536 nt11.05□□□□□ -0.64
PDR11P40550 THI73YLR004C 1572 nt11.04□□□□□ -0.64
PDR11P40550 OLA1YBR025C 1185 nt11.02□□□□□ -0.64
PDR11P40550 LEU4YNL104C 1860 nt11.02□□□□□ -0.65
PDR11P40550 YDR467CYDR467C 327 nt11.01□□□□□ -0.65
PDR11P40550 CWP2YKL096W-A 279 nt11.01□□□□□ -0.65
PDR11P40550 YBL095WYBL095W 813 nt11.01□□□□□ -0.65
PDR11P40550 HIS2YFR025C 1008 nt11.01□□□□□ -0.65
PDR11P40550 YLR358CYLR358C 564 nt11.01□□□□□ -0.65
PDR11P40550 YPT31YER031C 672 nt11□□□□□ -0.65
PDR11P40550 MEP1YGR121C 1479 nt10.97□□□□□ -0.65
PDR11P40550 RPR1RPR1 369 nt10.94□□□□□ -0.66
PDR11P40550 APT1YML022W 564 nt10.93□□□□□ -0.66
PDR11P40550 AAC3YBR085W 924 nt10.93□□□□□ -0.66
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