Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARGP37231 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PPARGP37231 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARGP37231 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PPARGP37231 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGP37231 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGP37231 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPARGP37231 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARGP37231 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARGP37231 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPARGP37231 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARGP37231 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARGP37231 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARGP37231 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPARGP37231 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGP37231 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGP37231 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPARGP37231 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPARGP37231 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPARGP37231 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARGP37231 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPARGP37231 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPARGP37231 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARGP37231 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARGP37231 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPARGP37231 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARGP37231 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARGP37231 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARGP37231 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPARGP37231 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGP37231 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPARGP37231 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGP37231 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGP37231 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGP37231 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGP37231 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPARGP37231 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGP37231 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPARGP37231 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGP37231 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGP37231 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGP37231 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGP37231 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGP37231 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPARGP37231 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGP37231 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGP37231 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGP37231 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGP37231 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPARGP37231 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGP37231 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGP37231 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGP37231 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPARGP37231 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPARGP37231 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGP37231 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGP37231 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGP37231 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPARGP37231 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGP37231 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGP37231 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGP37231 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGP37231 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPARGP37231 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPARGP37231 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPARGP37231 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPARGP37231 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPARGP37231 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGP37231 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGP37231 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGP37231 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGP37231 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGP37231 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPARGP37231 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGP37231 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGP37231 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGP37231 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPARGP37231 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGP37231 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGP37231 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGP37231 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGP37231 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPARGP37231 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGP37231 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPARGP37231 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPARGP37231 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms