Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX5P35711 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX5P35711 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX5P35711 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX5P35711 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX5P35711 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX5P35711 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX5P35711 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX5P35711 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX5P35711 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX5P35711 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX5P35711 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX5P35711 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX5P35711 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX5P35711 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX5P35711 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX5P35711 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX5P35711 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX5P35711 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX5P35711 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX5P35711 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX5P35711 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX5P35711 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX5P35711 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX5P35711 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX5P35711 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX5P35711 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX5P35711 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX5P35711 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX5P35711 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX5P35711 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX5P35711 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX5P35711 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX5P35711 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SOX5P35711 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SOX5P35711 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX5P35711 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX5P35711 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX5P35711 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX5P35711 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX5P35711 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX5P35711 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX5P35711 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX5P35711 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX5P35711 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX5P35711 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX5P35711 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX5P35711 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX5P35711 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX5P35711 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX5P35711 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX5P35711 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX5P35711 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX5P35711 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX5P35711 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX5P35711 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOX5P35711 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOX5P35711 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOX5P35711 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX5P35711 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX5P35711 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX5P35711 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX5P35711 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX5P35711 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX5P35711 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX5P35711 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX5P35711 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX5P35711 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX5P35711 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX5P35711 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX5P35711 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX5P35711 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX5P35711 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX5P35711 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX5P35711 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX5P35711 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOX5P35711 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SOX5P35711 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX5P35711 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX5P35711 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOX5P35711 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX5P35711 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX5P35711 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX5P35711 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX5P35711 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX5P35711 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX5P35711 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOX5P35711 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX5P35711 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX5P35711 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOX5P35711 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX5P35711 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX5P35711 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX5P35711 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX5P35711 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX5P35711 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX5P35711 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOX5P35711 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX5P35711 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX5P35711 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms