Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGER4P35408 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGER4P35408 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGER4P35408 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGER4P35408 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms