Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAP3P28838 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAP3P28838 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAP3P28838 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAP3P28838 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAP3P28838 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAP3P28838 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAP3P28838 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAP3P28838 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAP3P28838 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAP3P28838 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAP3P28838 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAP3P28838 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAP3P28838 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAP3P28838 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAP3P28838 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAP3P28838 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAP3P28838 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAP3P28838 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAP3P28838 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAP3P28838 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAP3P28838 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAP3P28838 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAP3P28838 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAP3P28838 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAP3P28838 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAP3P28838 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAP3P28838 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAP3P28838 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAP3P28838 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAP3P28838 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAP3P28838 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAP3P28838 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAP3P28838 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAP3P28838 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAP3P28838 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAP3P28838 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAP3P28838 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAP3P28838 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAP3P28838 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAP3P28838 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAP3P28838 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAP3P28838 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAP3P28838 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAP3P28838 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAP3P28838 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAP3P28838 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAP3P28838 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAP3P28838 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAP3P28838 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAP3P28838 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAP3P28838 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAP3P28838 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAP3P28838 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAP3P28838 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAP3P28838 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAP3P28838 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAP3P28838 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAP3P28838 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAP3P28838 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LAP3P28838 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LAP3P28838 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAP3P28838 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAP3P28838 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LAP3P28838 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAP3P28838 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LAP3P28838 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAP3P28838 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAP3P28838 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LAP3P28838 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAP3P28838 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAP3P28838 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAP3P28838 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAP3P28838 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAP3P28838 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAP3P28838 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAP3P28838 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAP3P28838 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAP3P28838 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAP3P28838 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAP3P28838 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAP3P28838 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAP3P28838 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAP3P28838 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAP3P28838 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAP3P28838 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms