Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
YY1P25490 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
YY1P25490 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
YY1P25490 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
YY1P25490 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
YY1P25490 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
YY1P25490 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
YY1P25490 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
YY1P25490 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
YY1P25490 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
YY1P25490 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
YY1P25490 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
YY1P25490 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
YY1P25490 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
YY1P25490 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
YY1P25490 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
YY1P25490 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
YY1P25490 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
YY1P25490 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
YY1P25490 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
YY1P25490 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
YY1P25490 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
YY1P25490 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
YY1P25490 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
YY1P25490 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YY1P25490 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YY1P25490 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
YY1P25490 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
YY1P25490 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
YY1P25490 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
YY1P25490 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
YY1P25490 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
YY1P25490 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
YY1P25490 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
YY1P25490 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
YY1P25490 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
YY1P25490 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YY1P25490 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
YY1P25490 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YY1P25490 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
YY1P25490 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
YY1P25490 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
YY1P25490 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
YY1P25490 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
YY1P25490 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
YY1P25490 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
YY1P25490 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
YY1P25490 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
YY1P25490 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
YY1P25490 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
YY1P25490 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
YY1P25490 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
YY1P25490 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
YY1P25490 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
YY1P25490 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
YY1P25490 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
YY1P25490 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
YY1P25490 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
YY1P25490 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
YY1P25490 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
YY1P25490 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
YY1P25490 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
YY1P25490 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
YY1P25490 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YY1P25490 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YY1P25490 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
YY1P25490 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YY1P25490 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
YY1P25490 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
YY1P25490 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
YY1P25490 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
YY1P25490 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
YY1P25490 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YY1P25490 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YY1P25490 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YY1P25490 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
YY1P25490 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YY1P25490 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
YY1P25490 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
YY1P25490 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
YY1P25490 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
YY1P25490 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
YY1P25490 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
YY1P25490 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
YY1P25490 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
YY1P25490 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YY1P25490 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
YY1P25490 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
YY1P25490 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
YY1P25490 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
YY1P25490 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
YY1P25490 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
YY1P25490 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
YY1P25490 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
YY1P25490 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
YY1P25490 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
YY1P25490 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
YY1P25490 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
YY1P25490 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
YY1P25490 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms