Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S100A1P23297 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S100A1P23297 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S100A1P23297 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S100A1P23297 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S100A1P23297 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S100A1P23297 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S100A1P23297 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S100A1P23297 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S100A1P23297 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S100A1P23297 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
S100A1P23297 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A1P23297 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A1P23297 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A1P23297 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A1P23297 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
S100A1P23297 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S100A1P23297 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S100A1P23297 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S100A1P23297 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S100A1P23297 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S100A1P23297 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S100A1P23297 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S100A1P23297 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S100A1P23297 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S100A1P23297 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S100A1P23297 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S100A1P23297 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S100A1P23297 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
S100A1P23297 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A1P23297 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A1P23297 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S100A1P23297 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S100A1P23297 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S100A1P23297 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
S100A1P23297 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S100A1P23297 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S100A1P23297 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S100A1P23297 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S100A1P23297 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S100A1P23297 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S100A1P23297 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S100A1P23297 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S100A1P23297 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S100A1P23297 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S100A1P23297 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S100A1P23297 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S100A1P23297 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A1P23297 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A1P23297 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A1P23297 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A1P23297 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A1P23297 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
S100A1P23297 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S100A1P23297 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
S100A1P23297 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
S100A1P23297 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
S100A1P23297 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S100A1P23297 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S100A1P23297 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
S100A1P23297 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S100A1P23297 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S100A1P23297 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S100A1P23297 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
S100A1P23297 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A1P23297 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A1P23297 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A1P23297 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A1P23297 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A1P23297 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S100A1P23297 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S100A1P23297 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
S100A1P23297 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
S100A1P23297 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
S100A1P23297 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A1P23297 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S100A1P23297 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S100A1P23297 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S100A1P23297 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S100A1P23297 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
S100A1P23297 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S100A1P23297 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
S100A1P23297 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S100A1P23297 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A1P23297 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A1P23297 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A1P23297 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A1P23297 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms