Protein–RNA interactions for Protein: P20434

RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, yeastyeast

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB5P20434 PHB2YGR231C 933 nt7.79□□□□□ -1.16
RPB5P20434 ADH3YMR083W 1128 nt7.79□□□□□ -1.16
RPB5P20434 PSD1YNL169C 1503 nt7.78□□□□□ -1.16
RPB5P20434 SBP1YHL034C 885 nt7.78□□□□□ -1.16
RPB5P20434 MOB1YIL106W 945 nt7.78□□□□□ -1.16
RPB5P20434 IPL1YPL209C 1104 nt7.78□□□□□ -1.16
RPB5P20434 SDS24YBR214W 1584 nt7.77□□□□□ -1.17
RPB5P20434 FLX1YIL134W 936 nt7.77□□□□□ -1.17
RPB5P20434 YHL008CYHL008C 1884 nt7.77□□□□□ -1.17
RPB5P20434 YPT11YNL304W 1254 nt7.76□□□□□ -1.17
RPB5P20434 YCR025CYCR025C 411 nt7.75□□□□□ -1.17
RPB5P20434 INH1YDL181W 258 nt7.75□□□□□ -1.17
RPB5P20434 YDR467CYDR467C 327 nt7.75□□□□□ -1.17
RPB5P20434 PUP1YOR157C 786 nt7.75□□□□□ -1.17
RPB5P20434 ENO1YGR254W 1314 nt7.75□□□□□ -1.17
RPB5P20434 LEU4YNL104C 1860 nt7.75□□□□□ -1.17
RPB5P20434 HXT10YFL011W 1641 nt7.74□□□□□ -1.17
RPB5P20434 GAL2YLR081W 1725 nt7.74□□□□□ -1.17
RPB5P20434 YHR218WYHR218W 1812 nt7.73□□□□□ -1.17
RPB5P20434 GAS1YMR307W 1680 nt7.73□□□□□ -1.17
RPB5P20434 VBA3YCL069W 1377 nt7.72□□□□□ -1.17
RPB5P20434 CYC3YAL039C 810 nt7.72□□□□□ -1.17
RPB5P20434 GPM1YKL152C 744 nt7.72□□□□□ -1.17
RPB5P20434 HXK1YFR053C 1458 nt7.72□□□□□ -1.17
RPB5P20434 PTC6YCR079W 1329 nt7.72□□□□□ -1.17
RPB5P20434 DTR1YBR180W 1719 nt7.72□□□□□ -1.17
RPB5P20434 GGA2YHR108W 1758 nt7.71□□□□□ -1.17
RPB5P20434 LYS20YDL182W 1287 nt7.69□□□□□ -1.18
RPB5P20434 AGP3YFL055W 1677 nt7.69□□□□□ -1.18
RPB5P20434 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.68□□□□□ -1.18
RPB5P20434 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.68□□□□□ -1.18
RPB5P20434 RSM7YJR113C 744 nt7.68□□□□□ -1.18
RPB5P20434 SRP102YKL154W 735 nt7.68□□□□□ -1.18
RPB5P20434 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.68□□□□□ -1.18
RPB5P20434 THI3YDL080C 1830 nt7.68□□□□□ -1.18
RPB5P20434 YBL095WYBL095W 813 nt7.67□□□□□ -1.18
RPB5P20434 ALD5YER073W 1563 nt7.65□□□□□ -1.18
RPB5P20434 YFR020WYFR020W 699 nt7.65□□□□□ -1.18
RPB5P20434 YLR280CYLR280C 351 nt7.65□□□□□ -1.18
RPB5P20434 SLG1YOR008C 1137 nt7.65□□□□□ -1.18
RPB5P20434 SER2YGR208W 930 nt7.64□□□□□ -1.19
RPB5P20434 YMC2YBR104W 990 nt7.64□□□□□ -1.19
RPB5P20434 NPP2YEL016C 1482 nt7.62□□□□□ -1.19
RPB5P20434 YCP4YCR004C 744 nt7.62□□□□□ -1.19
RPB5P20434 ERO1YML130C 1692 nt7.62□□□□□ -1.19
RPB5P20434 HTS1YPR033C 1641 nt7.62□□□□□ -1.19
RPB5P20434 TOK1YJL093C 2076 nt7.6□□□□□ -1.19
RPB5P20434 MRS4YKR052C 915 nt7.6□□□□□ -1.19
RPB5P20434 AAC3YBR085W 924 nt7.59□□□□□ -1.19
RPB5P20434 SAM50YNL026W 1455 nt7.59□□□□□ -1.19
RPB5P20434 YLR460CYLR460C 1131 nt7.58□□□□□ -1.2
RPB5P20434 BSP1YPR171W 1731 nt7.58□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YGR210CYGR210C 1236 nt7.57□□□□□ -1.2
RPB5P20434 TMS1YDR105C 1422 nt7.57□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YIR035CYIR035C 765 nt7.56□□□□□ -1.2
RPB5P20434 AAT1YKL106W 1356 nt7.56□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 TPN1YGL186C 1740 nt7.55□□□□□ -1.2
RPB5P20434 FRE6YLL051C 2139 nt7.54□□□□□ -1.2
RPB5P20434 SWM1YDR260C 513 nt7.54□□□□□ -1.2
RPB5P20434 CHS7YHR142W 951 nt7.54□□□□□ -1.2
RPB5P20434 MTO1YGL236C 2010 nt7.54□□□□□ -1.2
RPB5P20434 NBA1YOL070C 1506 nt7.53□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YJL009WYJL009W 327 nt7.53□□□□□ -1.2
RPB5P20434 YMR007WYMR007W 381 nt7.52□□□□□ -1.21
RPB5P20434 FCY1YPR062W 477 nt7.52□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YJR149WYJR149W 1215 nt7.51□□□□□ -1.21
RPB5P20434 BUB2YMR055C 921 nt7.51□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YMR166CYMR166C 1107 nt7.51□□□□□ -1.21
RPB5P20434 OLA1YBR025C 1185 nt7.51□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YPL108WYPL108W 507 nt7.51□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YIL177CYIL177C 5277 nt7.49□□□□□ -1.21
RPB5P20434 snR86snR86 1004 nt7.48□□□□□ -1.21
RPB5P20434 EMC3YKL207W 762 nt7.48□□□□□ -1.21
RPB5P20434 MET22YOL064C 1074 nt7.48□□□□□ -1.21
RPB5P20434 RCR1YBR005W 642 nt7.48□□□□□ -1.21
RPB5P20434 LSP1YPL004C 1026 nt7.48□□□□□ -1.21
RPB5P20434 TRP2YER090W 1524 nt7.47□□□□□ -1.21
RPB5P20434 OCH1YGL038C 1443 nt7.47□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YIA6YIL006W 1122 nt7.47□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YOR072WYOR072W 315 nt7.47□□□□□ -1.21
RPB5P20434 THI6YPL214C 1623 nt7.47□□□□□ -1.21
RPB5P20434 FET5YFL041W 1869 nt7.47□□□□□ -1.21
RPB5P20434 YBR056WYBR056W 1506 nt7.46□□□□□ -1.22
RPB5P20434 CAK1YFL029C 1107 nt7.45□□□□□ -1.22
RPB5P20434 RRT14YIL127C 621 nt7.45□□□□□ -1.22
RPB5P20434 PDC6YGR087C 1692 nt7.44□□□□□ -1.22
RPB5P20434 RNA170RNA170 169 nt7.43□□□□□ -1.22
RPB5P20434 RIB1YBL033C 1038 nt7.43□□□□□ -1.22
RPB5P20434 HXT11YOL156W 1704 nt7.42□□□□□ -1.22
RPB5P20434 MEP1YGR121C 1479 nt7.42□□□□□ -1.22
RPB5P20434 SOD2YHR008C 702 nt7.41□□□□□ -1.22
RPB5P20434 YJL160CYJL160C 864 nt7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms