Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
XRCC1P18887 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
XRCC1P18887 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
XRCC1P18887 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
XRCC1P18887 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XRCC1P18887 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XRCC1P18887 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms