Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GM2AP17900 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GM2AP17900 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GM2AP17900 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GM2AP17900 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GM2AP17900 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GM2AP17900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GM2AP17900 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GM2AP17900 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GM2AP17900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GM2AP17900 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GM2AP17900 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GM2AP17900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GM2AP17900 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GM2AP17900 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GM2AP17900 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GM2AP17900 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GM2AP17900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GM2AP17900 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GM2AP17900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GM2AP17900 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GM2AP17900 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GM2AP17900 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GM2AP17900 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GM2AP17900 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GM2AP17900 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GM2AP17900 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GM2AP17900 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GM2AP17900 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GM2AP17900 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GM2AP17900 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GM2AP17900 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GM2AP17900 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GM2AP17900 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GM2AP17900 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GM2AP17900 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GM2AP17900 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GM2AP17900 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GM2AP17900 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GM2AP17900 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GM2AP17900 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GM2AP17900 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GM2AP17900 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GM2AP17900 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GM2AP17900 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GM2AP17900 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GM2AP17900 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GM2AP17900 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GM2AP17900 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GM2AP17900 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GM2AP17900 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GM2AP17900 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GM2AP17900 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GM2AP17900 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GM2AP17900 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GM2AP17900 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GM2AP17900 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GM2AP17900 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GM2AP17900 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GM2AP17900 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GM2AP17900 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GM2AP17900 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GM2AP17900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GM2AP17900 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GM2AP17900 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GM2AP17900 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GM2AP17900 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GM2AP17900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GM2AP17900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GM2AP17900 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GM2AP17900 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GM2AP17900 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GM2AP17900 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GM2AP17900 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GM2AP17900 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GM2AP17900 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GM2AP17900 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GM2AP17900 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GM2AP17900 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GM2AP17900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GM2AP17900 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GM2AP17900 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GM2AP17900 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GM2AP17900 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GM2AP17900 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GM2AP17900 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GM2AP17900 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GM2AP17900 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GM2AP17900 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms