Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMD1P17707 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMD1P17707 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AMD1P17707 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
AMD1P17707 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMD1P17707 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMD1P17707 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMD1P17707 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMD1P17707 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AMD1P17707 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AMD1P17707 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMD1P17707 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AMD1P17707 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMD1P17707 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AMD1P17707 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMD1P17707 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMD1P17707 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMD1P17707 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMD1P17707 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMD1P17707 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMD1P17707 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMD1P17707 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMD1P17707 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMD1P17707 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMD1P17707 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMD1P17707 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMD1P17707 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMD1P17707 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMD1P17707 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMD1P17707 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMD1P17707 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AMD1P17707 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMD1P17707 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMD1P17707 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMD1P17707 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMD1P17707 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMD1P17707 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMD1P17707 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AMD1P17707 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMD1P17707 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AMD1P17707 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMD1P17707 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMD1P17707 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMD1P17707 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMD1P17707 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMD1P17707 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMD1P17707 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMD1P17707 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMD1P17707 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMD1P17707 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMD1P17707 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMD1P17707 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMD1P17707 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMD1P17707 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMD1P17707 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMD1P17707 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMD1P17707 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMD1P17707 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMD1P17707 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMD1P17707 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMD1P17707 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
AMD1P17707 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMD1P17707 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMD1P17707 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMD1P17707 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMD1P17707 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMD1P17707 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMD1P17707 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMD1P17707 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMD1P17707 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMD1P17707 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMD1P17707 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AMD1P17707 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMD1P17707 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AMD1P17707 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMD1P17707 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMD1P17707 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AMD1P17707 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMD1P17707 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMD1P17707 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AMD1P17707 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMD1P17707 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AMD1P17707 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMD1P17707 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMD1P17707 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMD1P17707 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AMD1P17707 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMD1P17707 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMD1P17707 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AMD1P17707 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMD1P17707 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
AMD1P17707 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMD1P17707 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMD1P17707 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AMD1P17707 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMD1P17707 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AMD1P17707 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AMD1P17707 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMD1P17707 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AMD1P17707 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms