Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTLA4P16410 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTLA4P16410 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CTLA4P16410 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTLA4P16410 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTLA4P16410 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTLA4P16410 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTLA4P16410 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTLA4P16410 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTLA4P16410 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms