Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRP12270 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRP12270 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPRP12270 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRP12270 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRP12270 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRP12270 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRP12270 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPRP12270 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRP12270 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPRP12270 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRP12270 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPRP12270 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TPRP12270 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRP12270 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRP12270 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRP12270 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPRP12270 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPRP12270 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRP12270 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPRP12270 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPRP12270 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPRP12270 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRP12270 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRP12270 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRP12270 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPRP12270 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPRP12270 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPRP12270 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPRP12270 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPRP12270 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRP12270 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRP12270 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRP12270 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPRP12270 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPRP12270 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPRP12270 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TPRP12270 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPRP12270 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPRP12270 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPRP12270 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPRP12270 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPRP12270 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPRP12270 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPRP12270 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPRP12270 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPRP12270 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TPRP12270 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRP12270 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRP12270 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPRP12270 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPRP12270 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRP12270 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPRP12270 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRP12270 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRP12270 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRP12270 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPRP12270 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPRP12270 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPRP12270 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRP12270 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRP12270 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPRP12270 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPRP12270 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPRP12270 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPRP12270 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRP12270 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRP12270 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRP12270 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRP12270 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPRP12270 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRP12270 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TPRP12270 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TPRP12270 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TPRP12270 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRP12270 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRP12270 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRP12270 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRP12270 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRP12270 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TPRP12270 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRP12270 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRP12270 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TPRP12270 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRP12270 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRP12270 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRP12270 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TPRP12270 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms