Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGAMP11215 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGAMP11215 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGAMP11215 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAMP11215 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAMP11215 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms