Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAA2P0DJI9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAA2P0DJI9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAA2P0DJI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SAA2P0DJI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SAA2P0DJI9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SAA2P0DJI9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SAA2P0DJI9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAA2P0DJI9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SAA2P0DJI9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms