Protein–RNA interactions for Protein: P0CB38

PABPC4L, Polyadenylate-binding protein 4-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4LP0CB38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PABPC4LP0CB38 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PABPC4LP0CB38 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PABPC4LP0CB38 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PABPC4LP0CB38 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC4LP0CB38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms