Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FREM3P0C091 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FREM3P0C091 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FREM3P0C091 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FREM3P0C091 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FREM3P0C091 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms