Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC3P02656 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
APOC3P02656 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC3P02656 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC3P02656 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC3P02656 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
APOC3P02656 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC3P02656 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC3P02656 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
APOC3P02656 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC3P02656 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
APOC3P02656 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC3P02656 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
APOC3P02656 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOC3P02656 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
APOC3P02656 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC3P02656 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC3P02656 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC3P02656 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
APOC3P02656 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC3P02656 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
APOC3P02656 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
APOC3P02656 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC3P02656 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC3P02656 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC3P02656 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC3P02656 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
APOC3P02656 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC3P02656 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC3P02656 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC3P02656 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
APOC3P02656 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC3P02656 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
APOC3P02656 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC3P02656 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC3P02656 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC3P02656 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
APOC3P02656 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC3P02656 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
APOC3P02656 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
APOC3P02656 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC3P02656 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
APOC3P02656 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
APOC3P02656 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC3P02656 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC3P02656 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
APOC3P02656 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC3P02656 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
APOC3P02656 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC3P02656 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC3P02656 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOC3P02656 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC3P02656 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC3P02656 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC3P02656 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOC3P02656 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC3P02656 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOC3P02656 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC3P02656 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC3P02656 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOC3P02656 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOC3P02656 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC3P02656 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOC3P02656 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC3P02656 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC3P02656 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC3P02656 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC3P02656 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC3P02656 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC3P02656 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC3P02656 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC3P02656 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC3P02656 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC3P02656 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC3P02656 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC3P02656 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC3P02656 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC3P02656 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC3P02656 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC3P02656 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC3P02656 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC3P02656 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC3P02656 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC3P02656 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC3P02656 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC3P02656 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC3P02656 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC3P02656 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC3P02656 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOC3P02656 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC3P02656 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOC3P02656 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms