Protein–RNA interactions for Protein: P02538

KRT6A, Keratin, type II cytoskeletal 6A, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6AP02538 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT6AP02538 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT6AP02538 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRT6AP02538 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KRT6AP02538 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT6AP02538 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT6AP02538 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT6AP02538 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KRT6AP02538 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms