Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDH8O95206 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDH8O95206 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH8O95206 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH8O95206 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCDH8O95206 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCDH8O95206 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms