Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSDE1O75534 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSDE1O75534 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSDE1O75534 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSDE1O75534 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSDE1O75534 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSDE1O75534 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSDE1O75534 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSDE1O75534 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSDE1O75534 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSDE1O75534 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms