Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KATNA1O75449 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KATNA1O75449 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KATNA1O75449 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KATNA1O75449 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KATNA1O75449 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms