Protein–RNA interactions for Protein: O75326

SEMA7A, Semaphorin-7A, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA7AO75326 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA7AO75326 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA7AO75326 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA7AO75326 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA7AO75326 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA7AO75326 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms