Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATP8B3O60423 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP8B3O60423 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8B3O60423 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8B3O60423 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8B3O60423 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8B3O60423 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms