Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX15O60248 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX15O60248 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX15O60248 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX15O60248 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX15O60248 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX15O60248 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX15O60248 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX15O60248 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX15O60248 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX15O60248 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SOX15O60248 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX15O60248 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX15O60248 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX15O60248 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX15O60248 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SOX15O60248 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX15O60248 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SOX15O60248 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SOX15O60248 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX15O60248 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX15O60248 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX15O60248 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX15O60248 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX15O60248 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SOX15O60248 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX15O60248 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX15O60248 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX15O60248 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SOX15O60248 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX15O60248 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX15O60248 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SOX15O60248 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX15O60248 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX15O60248 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SOX15O60248 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX15O60248 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX15O60248 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX15O60248 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SOX15O60248 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX15O60248 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX15O60248 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX15O60248 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX15O60248 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SOX15O60248 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX15O60248 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX15O60248 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX15O60248 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SOX15O60248 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SOX15O60248 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SOX15O60248 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SOX15O60248 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SOX15O60248 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SOX15O60248 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOX15O60248 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOX15O60248 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOX15O60248 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOX15O60248 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOX15O60248 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SOX15O60248 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SOX15O60248 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOX15O60248 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms