Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NDUFS5O43920 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NDUFS5O43920 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NDUFS5O43920 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NDUFS5O43920 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFS5O43920 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFS5O43920 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFS5O43920 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFS5O43920 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFS5O43920 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFS5O43920 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFS5O43920 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFS5O43920 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFS5O43920 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFS5O43920 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFS5O43920 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFS5O43920 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFS5O43920 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NDUFS5O43920 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms