Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SSNA1O43805 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSNA1O43805 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSNA1O43805 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSNA1O43805 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSNA1O43805 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSNA1O43805 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSNA1O43805 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSNA1O43805 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms