Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRXO43186 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CRXO43186 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRXO43186 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRXO43186 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRXO43186 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRXO43186 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRXO43186 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CRXO43186 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRXO43186 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRXO43186 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRXO43186 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CRXO43186 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRXO43186 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRXO43186 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRXO43186 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CRXO43186 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRXO43186 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRXO43186 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRXO43186 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CRXO43186 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRXO43186 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CRXO43186 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CRXO43186 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRXO43186 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CRXO43186 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRXO43186 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CRXO43186 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CRXO43186 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRXO43186 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRXO43186 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CRXO43186 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CRXO43186 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CRXO43186 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRXO43186 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRXO43186 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRXO43186 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRXO43186 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CRXO43186 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRXO43186 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRXO43186 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRXO43186 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CRXO43186 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CRXO43186 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CRXO43186 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CRXO43186 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CRXO43186 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CRXO43186 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CRXO43186 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CRXO43186 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CRXO43186 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CRXO43186 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CRXO43186 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CRXO43186 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CRXO43186 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CRXO43186 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CRXO43186 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRXO43186 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRXO43186 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRXO43186 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRXO43186 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CRXO43186 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRXO43186 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CRXO43186 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRXO43186 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRXO43186 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRXO43186 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRXO43186 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CRXO43186 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms