Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C417 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C417 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C417 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C417 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C417 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C417 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C417 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C417 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C417 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C417 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C417 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C417 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C417 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C417 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C417 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C417 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C417 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C417 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C417 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C417 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C417 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C417 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C417 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C417 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C417 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H7C417 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C417 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H7C417 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H7C417 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C417 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H7C417 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H7C417 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C417 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C417 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C417 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H7C417 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C417 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H7C417 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H7C417 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C417 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C417 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C417 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H7C417 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C417 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C417 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H7C417 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H7C417 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C417 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C417 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H7C417 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C417 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C417 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H7C417 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C417 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C417 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H7C417 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C417 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C417 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C417 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H7C417 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C417 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C417 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C417 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H7C417 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C417 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C417 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C417 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
H7C417 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H7C417 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H7C417 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H7C417 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms