Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TTC26A0AVF1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTC26A0AVF1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTC26A0AVF1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTC26A0AVF1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTC26A0AVF1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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